Lapis lazuli taşının, Alın Çakrası (Üçüncü Göz), Boğaz Çakrası ve Taç Çakra ile uyumlu olduğu düşünülmektedir. Alın Çakrası ile olan bağlantısının, sezgiyi güçlendirdiğine ve zihinsel farkındalığı artırdığına inanılır. Bu taşın, içsel bilgelik ve derin ruhsal rehberlik sağladığı kabul edilmektedir. Boğaz Çakrası ile uyumlu olduğunda, lapis lazulinin açık ve dürüst bir iletişimi teşvik ettiği, kişinin kendini daha net bir şekilde ifade etmesine yardımcı olduğu bilinmektedir. Taç Çakra ile olan uyumunun ise, ruhsal farkındalığı derinleştirerek ilahi bilgilere erişimi kolaylaştırdığı düşünülmektedir. Bu taşın, hem zihinsel hem de ruhsal dengeyi sağlamaya yardımcı olduğu kabul edilir.